臺南市政府工務局架構圖說明：
局長→副局長 →主任秘書→專門委員→機要秘書 →總工程司→副總工程司 共有15個行政科室如下： 秘書室、人事室、會計室、政風室 工程企劃科、採購品管科、建築管理科、使用管理科、新建工程科、建築工程科、公園管理科、養護工程科、第一工務大隊、第二工務大隊、第三工務大隊
